شوراي علمي پژوهشكده به عنوان عالي‌ترين مرجع تصميم‌گيري در امور مربوط به تصميم‌هاي مديريتي و برخي سياست‌گذاري‌ها، در تمامي مراكز پژوهشي، داراي جايگاه ويژه‌اي است. اين شورا در خصوص تمام موارد زير قادر به اخذ تصميم بوده و مصوبات آن براي كليه‌ي واحدهاي تحت امر پژوهشكده لازم‌الاجرا مي‌باشد. از جمله معمول‌ترين اموري كه شوراي علمي به آن‌ها مي‌پردازد عبارتند از:
1. طرح‌هاي پژوهشي
1-1 بررسي عنوان و تصميم‌گيري در مورد آن؛
2-1 بررسي پروپوزال و تصويب يا رد آن با ذكر دلايل رد؛
3-1 بررسي گزارش پيشرفت طرح‌ها و نيز تأخيرهاي به وجود آمده؛
4-1 بررسي گزارش پاياني طرح‌ها و تصميم‌گيري در مورد آن‌ها و تأخيرهاي پديدآمده؛
5-1 بررسي درخواست داده از پايگاه داده‌هاي طرح‌ها؛
6-1 بررسي مقالات ارائه شده از طرح‌ها
2. كنفرانس‌ها و سمينارها
3. فرصت‌هاي مطالعاتي
4. بررسي عملكرد سالانه پژوهشكده
